为了更好地体现今年“名城会”的主题定位及主要内容，组委会组织征集设计了新会标。新会标以梅红色为主色调，以国画为主要表现形式，以梅花和2006年“名城会”的中英文名称为元素而构成。采用遒劲的国画笔触将“世界历史文化名城博览会”的英文缩写“WHCCE”勾勒出南京市市花——梅花的造型。
　　
    梅花具有傲立风雪的顽强品质，是南京这座历经沧桑的历史文化名城的象征。会标中的梅花极具动感的造型，寓意着南京是一个充满生机与活力的城市。会标既具有浓郁的南京地域特色，同时也体现了“名城会”的国际化色彩。中、英两种文字点明的“名城会”名称象征着“名城会”是中外文化交流的平台。“名城会”名称上方的一抹红色国画笔触既象征着南京文脉源远流长，也象征着东西方文化融会贯通。会标采用红色，寓意热情、希望和生机，代表热情的南京人民与海内外朋友们“相聚在文化名城，狂欢在博爱之都”的期盼与喜悦之情，也象征着南京文化事业和文化产业的蓬勃发展。